花蛤殼內的東西都是可以吃的，但在生活中，很多人會選擇不吃蛤蜊肉中的黑色部位。需要注意的是花蛤在烹飪之前，應將花蛤中的細小沙粒清除干凈，避免影響口感。

蛤蜊肉中的黑色部分是蛤蜊的內臟，也被稱為黃，具有一定的營養價值，但是含有的膽固醇含量也比較高。蛤蜊的內臟受蛤蜊體積的影響較為聚集，而且會含有少量沒完全消化的泥沙以及排泄物，因此不建議食用。

通常，在烹飪蛤蜊前，會直接將蛤蜊的黑色部分去除掉。但難免會有清除不干凈的情況，就需要在烹飪前先用海水將蛤蜊浸泡一段時間，讓蛤蜊將身體中的沙粒吐出。如果沒有海水，就不需要這個工序，只需要顛一顛蛤蜊，然后清洗干凈就可以了。

雖然花蛤殼內的所有部位都能使用，但是已經死亡的蛤蜊是不能食用的，以免出現身體不適的癥狀。買回家的蛤蜊在判斷新鮮程度的時候，可以用溫水焯蛤蜊，鮮活的蛤蜊用水一焯就會張開，而焯水后不開殼，或者開殼后肉是兩邊都掛著不容易掉下來的，是已經死亡的蛤蜊，不能使食用。